Οι συγγενείς ανωμαλίες του κρανίου και του προσώπου ποικίλουν από τον απλό χαλινό της γλώσσας έως κρανιοπροσωπικές δυσμορφίες (όπως κρανιοσυνοστεώσεις, σχιστίες, συγγενείς σπίλοι). Η πολύπλοκη ανατομία επιβάλλει τη συνεργασία διαφορετικών ειδικοτήτων για την πλήρη εν καιρώ αποκατάσταση.
Ιδιαίτερης αναφοράς χρήζει η κρανιοσυνοστέωση. Πρόκειται για το πρόωρο κλείσιμο των σημείων (ονομάζονται «ραφές») στα οποία εφάπτονται τα επιμέρους οστά που αποτελούν το κρανίο στην αρχή της ζωής μας. Το αποτέλεσμα είναι, ανάλογα με το ποιες και πόσες ραφές εμπλέκονται, η διαταραχή στην ανάπτυξη του κρανίου που μπορεί να προκαλέσει δυσμορφία (όπως για παράδειγμα τριγωνοκεφαλία, βραχυκεφαλία, σκαφοκεφαλία) αλλά και, στις βαρύτερες περιπτώσεις, να επηρεάσει την ανάπτυξη του εγκεφάλου με καταστροφικές επιπτώσεις. Ευτυχώς η έγκαιρη διάγνωση και η επιτυχής παρέμβαση, με την συνεργασία νευροχειρουργού και κρανιοπροσωπικού χειρουργού, καθιστούν απόλυτα φυσιολογική τη ζωή των παιδιών όταν δεν συνυπάρχουν άλλα γονιδιακά αίτια.